MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 8495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018078	GCC	2	6	2326136	2326141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4502	NC_018078	AGT	2	6	2326164	2326169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_018078	GAAC	2	8	2326205	2326212	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4504	NC_018078	GCGA	2	8	2330615	2330622	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4505	NC_018078	CGA	2	6	2330705	2330710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_018078	GCC	2	6	2330715	2330720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4507	NC_018078	GCT	2	6	2333173	2333178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_018078	GTG	2	6	2333222	2333227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_018078	GAG	2	6	2333277	2333282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_018078	CG	3	6	2334841	2334846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4511	NC_018078	CCG	2	6	2335563	2335568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4512	NC_018078	CGG	2	6	2335603	2335608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_018078	GTA	2	6	2335643	2335648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_018078	GCCA	2	8	2335696	2335703	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4515	NC_018078	GTA	2	6	2335770	2335775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_018078	GTC	2	6	2335776	2335781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_018078	GGA	2	6	2335816	2335821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_018078	CCGC	2	8	2338070	2338077	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4519	NC_018078	GA	3	6	2338084	2338089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_018078	CAT	2	6	2342991	2342996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_018078	GGA	2	6	2343007	2343012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_018078	TTG	2	6	2343913	2343918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_018078	CCCCA	2	10	2343946	2343955	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
4524	NC_018078	GCC	2	6	2343989	2343994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4525	NC_018078	AGC	2	6	2344031	2344036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_018078	ACCC	2	8	2344050	2344057	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4527	NC_018078	CGA	2	6	2344095	2344100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_018078	CCCTCT	2	12	2346963	2346974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4529	NC_018078	GA	3	6	2347000	2347005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_018078	CGG	2	6	2347049	2347054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_018078	CG	3	6	2347103	2347108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4532	NC_018078	AC	3	6	2347223	2347228	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4533	NC_018078	GAG	2	6	2347239	2347244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_018078	AG	3	6	2348005	2348010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_018078	AAT	2	6	2348161	2348166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_018078	GC	3	6	2348184	2348189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4537	NC_018078	TCG	2	6	2348191	2348196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_018078	CG	3	6	2348213	2348218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4539	NC_018078	CCT	2	6	2348219	2348224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4540	NC_018078	CCG	2	6	2348229	2348234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4541	NC_018078	TCG	2	6	2348247	2348252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_018078	CG	3	6	2348269	2348274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4543	NC_018078	CCT	2	6	2348275	2348280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4544	NC_018078	CCG	2	6	2348285	2348290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4545	NC_018078	GC	3	6	2348296	2348301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4546	NC_018078	TCG	2	6	2348303	2348308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_018078	CGA	2	6	2348858	2348863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_018078	CGAA	2	8	2348910	2348917	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4549	NC_018078	GCT	2	6	2350158	2350163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_018078	CGGC	2	8	2350202	2350209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4551	NC_018078	TAT	2	6	2350231	2350236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_018078	TAC	2	6	2350243	2350248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_018078	TGCCC	2	10	2350324	2350333	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4554	NC_018078	ATCTC	2	10	2351720	2351729	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4555	NC_018078	TC	3	6	2352119	2352124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4556	NC_018078	CGA	2	6	2353692	2353697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_018078	GC	3	6	2353699	2353704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4558	NC_018078	CGG	2	6	2353710	2353715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_018078	GAG	2	6	2353719	2353724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_018078	CGA	2	6	2353748	2353753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_018078	GC	3	6	2353755	2353760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4562	NC_018078	CGG	2	6	2353766	2353771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_018078	GAG	2	6	2358008	2358013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_018078	ACG	2	6	2361637	2361642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_018078	GTCGC	2	10	2361655	2361664	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4566	NC_018078	GAG	2	6	2361685	2361690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_018078	CTC	2	6	2363165	2363170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4568	NC_018078	GCGG	2	8	2363193	2363200	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4569	NC_018078	TCG	2	6	2363214	2363219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_018078	CTC	2	6	2363242	2363247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4571	NC_018078	GCGG	2	8	2363270	2363277	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4572	NC_018078	TCG	2	6	2363291	2363296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_018078	GCTT	2	8	2363342	2363349	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4574	NC_018078	CGA	2	6	2363431	2363436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_018078	TC	3	6	2363454	2363459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4576	NC_018078	CGA	2	6	2363484	2363489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_018078	CGG	2	6	2363591	2363596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_018078	CCA	2	6	2363712	2363717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4579	NC_018078	GCA	2	6	2363782	2363787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_018078	AC	3	6	2364517	2364522	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4581	NC_018078	TGG	2	6	2364534	2364539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_018078	CGCC	2	8	2365256	2365263	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4583	NC_018078	GAC	2	6	2366307	2366312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_018078	GTT	2	6	2366342	2366347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_018078	CGGT	2	8	2366355	2366362	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4586	NC_018078	AC	3	6	2366424	2366429	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4587	NC_018078	ACCGA	2	10	2366447	2366456	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4588	NC_018078	GTGG	2	8	2366462	2366469	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_018078	GATC	2	8	2366494	2366501	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4590	NC_018078	ACCG	2	8	2366614	2366621	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4591	NC_018078	AGCCGA	2	12	2367087	2367098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_018078	GCT	2	6	2367113	2367118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_018078	G	6	6	2367179	2367184	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_018078	ATG	2	6	2367232	2367237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_018078	AGG	2	6	2367311	2367316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_018078	CGG	3	9	2367352	2367360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_018078	GTC	2	6	2367373	2367378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4598	NC_018078	GACGGC	2	12	2369334	2369345	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_018078	CAG	2	6	2369367	2369372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_018078	CAC	2	6	2369416	2369421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4601	NC_018078	ACC	2	6	2369422	2369427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4602	NC_018078	CAC	2	6	2369431	2369436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4603	NC_018078	CTG	2	6	2369836	2369841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_018078	TACC	2	8	2369898	2369905	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4605	NC_018078	CCG	2	6	2369934	2369939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4606	NC_018078	CTGG	2	8	2371499	2371506	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4607	NC_018078	GCCA	2	8	2371509	2371516	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4608	NC_018078	TC	3	6	2371545	2371550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4609	NC_018078	GCC	2	6	2372858	2372863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4610	NC_018078	CCA	2	6	2372891	2372896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4611	NC_018078	GCT	2	6	2372966	2372971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_018078	CG	3	6	2373054	2373059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4613	NC_018078	ACCC	2	8	2373137	2373144	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4614	NC_018078	TCT	2	6	2374683	2374688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_018078	GAC	2	6	2374696	2374701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_018078	TCAC	2	8	2374752	2374759	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4617	NC_018078	TCGGA	2	10	2374842	2374851	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4618	NC_018078	GTC	2	6	2374860	2374865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_018078	CCT	2	6	2374908	2374913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4620	NC_018078	GCACA	2	10	2374942	2374951	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4621	NC_018078	CAG	2	6	2374966	2374971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_018078	ACC	2	6	2374972	2374977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_018078	CAC	2	6	2375009	2375014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4624	NC_018078	CCGG	2	8	2375024	2375031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4625	NC_018078	CG	3	6	2375184	2375189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4626	NC_018078	CAG	2	6	2375269	2375274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_018078	ATC	2	6	2375780	2375785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_018078	TCAGA	2	10	2376701	2376710	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4629	NC_018078	AG	3	6	2377095	2377100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4631	NC_018078	CAAC	2	8	2379251	2379258	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4888	NC_018078	CGGC	2	8	2493980	2493987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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